您的位置:网站首页 > 师资队伍 > 化学信息学 > 正 文

姚小军 (教授)★

【来源:兰州大学化学化工学院 | 发布日期:2016-12-08 】     【选择字号:
姓  名
姚小军
所属部门
化学信息学
职  称
教授
导师类别
博士生导师
研究方向
机器学习算法在化学和生物学中的应用,计算机辅助分子设计,生物大分子与药物小分子之间的相互作用研究,生物信息学
联系方式

姚小军教授 (Professor Xiaojun Yao),博士生导师。男,1976年3月生。1998年本科毕业于兰州大学化学系高分子化学专业。1998年至2003年,在兰州大学化学系分析化学专业攻读博士学位。2002年至2005年,在法国巴黎第七大学攻读化学信息与理论化学专业博士学位。2005年1月起在兰州大学化学化工学院工作。曾获促进科学技术研究中法协会信息科学奖、法国华人青年企业家协会教育基金会优秀中国留学人员奖、国家留学基金委优秀自费留学生奖学金等奖励。2007年入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”。先后主持和完成国家自然科学基金青年基金项目和面上项目、教育部新世纪优秀人才支持计划项目、教育部留学回国人员启动基金以及3项横向课题。目前担任中国化学会计算机化学专业委员会委员以及Current Pharmaceutical Design刊物编委。目前的主要研究兴趣包括:发展和应用化学信息、分子模拟以及复杂网络分析方法,研究与肿瘤相关信号通路、病毒感染和复制等过程相关的生物大分子的结构、功能及其调控机制;结合化学信息学、分子模拟和生物活性评价,发现和设计具有抗肿瘤和抗病毒活性的苗头或者先导化合物。

近5年代表性论文(Representative Publications):

1.       Exploring the molecular mechanism of cross-resistance to HIV-1 integrase strand transfer inhibitors by molecular dynamics simulation and residue interaction network analysis. J Chem Inf Model. 2013, 53: 210-222.

2.       Influence of Interface Structure on the Properties of ZnO/Graphene Composites: A Theoretical Study by Density Functional Theory Calculations J. Phys. Chem. C, 2013, 117:10536–10544

3.       Molecular mechanism of HIV-1 integrase-vDNA interactions and strand transfer inhibitor action: a molecular modeling perspective. J Comput Chem. 2012, 33:527-536.

4.       A sequence-based computational model for the prediction of the solvent accessible surface area for α-helix and β-barrel transmembrane residues. J Comput Chem. 2012, 33:11-17

5.       Molecular dynamics simulation and free energy calculation studies of the binding mechanism of allosteric inhibitors with p38α MAP kinase. J Chem Inf Model. 2011, 51:3235-3246.

6.       Molecular modeling study of checkpoint kinase 1 inhibitors by multiple docking strategies and prime/MM-GBSA calculation. J Comput Chem. 2011, 32: 2800-2809.

7.       In silico prediction of deleterious single amino acid polymorphisms from amino acid sequence. J Comput Chem. 2011, 32:1211-1216.

8.       Molecular dynamics simulation, free energy calculation and structure-based 3D-QSAR studies of B-RAF kinase inhibitors. J Chem Inf Model. 2011, 51:680-692.

9.       A combined molecular modeling study on gelatinases and their potent inhibitors. J Comput Chem. 2010, 31:24-42.

10.     A novel method for protein-ligand binding affinity prediction and the related descriptors exploration. J Comput Chem. 2009, 30:900-909.